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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
25/07/2022 |
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Data da última atualização: |
25/07/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, C. G. dos; SOUSA, M. F.; VIEIRA, J. I. G.; MORAIS, L. R. de; FERNANDES, A. A. S.; LITTIERE, T. de O.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; BONAFÉ, C. M.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. |
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Afiliação: |
CASSIANE GOMES DOS SANTOS, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; MARIELE FREITAS SOUSA, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; JOÃO INÁCIO GOMES VIEIRA, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; LUANA RAFAELA DE MORAIS, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; ALINE AUXILIADORA SILVA FERNANDES, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; THAYSSA DE OLIVEIRA LITTIERE, Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho"; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; CRISTINA MOREIRA BONAFÉ, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; ANA FABRÍCIA BRAGA MAGALHÃES, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; LUCAS LIMA VERARDO, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri. |
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Título: |
Candidate genes for tick resistance in cattle: a systematic review combining post-GWAS analyses with sequencing data. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Applied Animal Research, v. 50, n. 1, p. 460-470, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1080/09712119.2022.2096035 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Rhipicephalus microplus causes huge losses in cattle. Host genetic background greatly affects the immune efficiency in resistance or susceptibility to tick infestation, which is one of the many factors that play a role on that trait. We performed a systematic review of genome-wide association studies (GWAS) for tick resistance in cattle resulting in 1353 candidate genes for post-GWAS analyses. From those, genes showing possible structural variants from the bovine genome were classified by the Variant Effect Predictor from Ensembl. Ninety-two candidate genes showed potential structural variants in 5' UTR and coding region and were used for functional annotation. Enriched biological processes (e.g. regulation of eosinophil chemotaxis, RIG-I signalling pathway and monocyte differentiation) and candidate genes (e.g. DAPK2, PUM1, ACIN1, INPP5D) linked with immune system function were identified and thus associated with tick resistance. Besides, gene-transcription factors (TFs) networks were obtained from TFs associated with immune system (FOXO3, PPARG, STAT3, NFKB1, GATA3 and ARNT) and the candidate genes associated with tick resistance in cattle highlighted (e.g. OR4L1, PNP, LRRIQ1, GIMAP8, MYO6, MEP1A and LRFN2). Thus, promising candidate genes with a possible functional role for tick resistance in cattle are presented for further in vitro and/or in vivo analyses. |
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Palavras-Chave: |
Ectoparasita; Sistema imunológico. |
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Thesagro: |
Bovino; Carne; Carrapato; Genoma; Hospedeiro Animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144893/1/Candidate-genes-for-tick-resistance-in-cattle.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 2. |  | SILVA, M. V. G. B.; VERARDO, L. L.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; CAROLINO, I.; CAROLINO, N. Candidate genes for disease, reproduction and meat quality traits in Portuguese native breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 12., 2022, Rotterdam. Proceedings... Rotterdam: [s.n.], 2022.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | VERARDO, L. L.; SILVA, F. F.; VARONA, L.; RESENDE, M. D. V. de; BASTIAANSEN, J. W. M.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Bayesian GWAS and network analysis revealed new candidate genes for number of teats in pigs. Journal of Applied Genetics, v. 56, n. 1, p. 123-132, Feb. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 4. | | CARVALHO, L. S.; ALMEIDA, E. A. R.; SOUZA, K. G. L. de; SILVA, M. V. G. B.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Análise funcional de genes candidatos associados à resistência ao carrapato em bovinos da raça Gir. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 2.; SEMANA DA ZOOTECNIA, 15., 2023, Diamantina. Rumo ao futuro: [anais]. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023. p. 24-26.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | ALMEIDA, E. A. R.; PEREIRA, J. R.; CARVALHO, L. S.; SILVA, M. V. G. B.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Análises pós-estudo de associação no genoma de bovinos da raça Gir para a identificação de genes candidatos para perfil de ácidos graxos no leite. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 2.; SEMANA DA ZOOTECNIA, 15., 2023, Diamantina. Rumo ao futuro: [anais]. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023. p. 36-38.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | PANETTO, J. C. do C.; VERARDO, L. L.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; FAZA, D. R. L. R.; SILVA, M. V. G. B. Genotype by environment interaction in Brazilian Dairy Gir cattle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | FERNANDES, A. A. S.; VIEIRA, J. I. G.; FERREIRA, P. H.; MAGALHÃES, A. F. B.; SILVA, M. V. G. B.; VERARDO, L. L. An insertion in Caracu breed genome with a possible role in fatty acids profile. In: REUNIÃO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 57., 2022, Campinas. Tropical animal science and pratice to feed the planet: proceedings. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia; São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2022. p. 232.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | VERARDO, L. L.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; REIS, D. R. de L.; EGITO, A. A. do; VITORINO, A. S. M.; CAROLINO, M. I. C. M.; CAROLINO, N. P.; SILVA, M. V. G. B. Exploring the genetic origin of Brazilian locally adapted breeds: admixture, population history and relationship with Portuguese and indicine cattle. Livestock Science, v. 282, 105455, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | DUARTE, D. A. S.; FORTES, M. R. S.; DUARTE, M. de S.; GUIMARÃES, S. E. F.; VERARDO, L. L.; VERONEZE, R.; RIBEIRO, A. M. F.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Genome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs. Animal Production Science, v. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 10. | | VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018. 6 p. Na publicação: A. Zerlotini, J. C. C. Panetto. WCGALP 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 12. | | PEREIRA, H. P.; VERARDO, L. L.; WELLER, M. M. D. C. A.; SBARDELLA, A. P.; MUNARI, D. P.; DAIBERT, R. M. de P.; CARVALHO, W. A.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F. Going further post-RNA-seq: in silico functional analyses revealing candidate genes and regulatory elements related to mastitis in dairy cattle. Journal of Dairy Research, v. 88, p. 286-292, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. | | NASCIMENTO, C. S.; PEIXOTO, J. de O.; VERARDO, L. L.; CAMPOS, C. F.; WELLER, M. M. C.; FARIA, V. R.; BOTELHO, M. E.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Transcript profiling of expressed sequence tag from semimembranosus muscle of commercial and naturalized pig breeds. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 3, p. 3315-3328. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 14. | | CAMPOS, B. M.; CARMO, A. S. do; SILVA, T. B. R. da; VERARDO, L. L.; GOUVEIA, J. J. de S.; MALHADO, C. H. M.; SILVA, M. V. G. B.; CARNEIRO, P. L. S. Identification of artificial selection signatures in Caracu breed lines selected for milk production and meat production. Livestock Science, v. 206, p. 82-87, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 15. | | VERARDO, L. L.; NASCIMENTO, C. S.; SILVA, F. F.; GASPARINO, E.; MARTINS, M. F.; TORIYAMA, E.; FARIA, V. R.; BOTELHO, M. E.; COSTA, K. A.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Identification and validation of differentially expressed genes from pig skeletal muscle. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 130, n. 5, p. 372-381, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | PAIXÃO, D. M.; CARNEIRO, P. L. S.; PAIVA, S. R.; SOUSA, K. R. S.; VERARDO, L. L.; BRACCINI NETO, J.; PINTO, A. P. G.; HIDALGO, A. M.; NASCIMENTO, C. S. do; PÉRISSÉ, I. V.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Mapeamento de QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em suínos: características de carcaça e qualidade de carne. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 64, n. 4, p. 974-982, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | VIEIRA, J. I. G.; BRAGA, L. G.; CHU, T. C. S.; FERREIRA, P. H.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, D. B. dos S.; BONAFÉ, C. M.; MAGALHÃES, A. F. B.; SILVA, M. V. G. B.; VERARDO, L. L. Resequencing of Brazilian locally adapted cattle breeds revealed variants in candidate genes and transcription factors for meat fatty acid profile. Journal of Animal Breeding and Genetics, 2024. First online.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. de A. R.; PAIVA, L. DE C.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VERARDO, L. L.; GONÇALVES, G. S.; REIS, D. R. de L.; MENDONÇA JÚNIOR, C. F.; BRAGA, F. do A.; FRANZON, C. de A. Programa de melhoramento genético da raça Girolando - Avaliação genômica de fêmeas jovens - junho/2017. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2017. 20 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 205)| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; SILVA, F. F. e; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F.; PAIXÃO, D. M.; BARROSO, L. M. A.; VERARDO, L. L.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S. Factor analysis applied to genome prediction for high-dimensional phenotypes in pigs. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 2, 2016. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 20. | | CAMPOS, B. M.; CARMO, A. S. do; EGITO, A. A. do; MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. S. M. do; GOUVEIA, J. J. S. de; MALHADO, C. H. M.; VERARDO, L. L.; SILVA, M. V. G. B. da; CARNEIRO, P. L. S. Genetic diversity, population structure, and correlations between locally adapted zebu and taurine breeds in Brazil using SNP markers. Tropical Animal Health and Production, v. 49, n. 8, p 1677-1684, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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